当组织建立了环境管理体系之后，通过管理活动程序、建立规范化文件和记录等措施可以协调不同的职能部门之间的关系，并可以达到下列目的：
①建立一个良好的环境方针和环境管理基础；
②有利于找出并控制重大的环境因素和影响；
③有利于识别有关的环境法规要求与现行状况的差距；
④减少由于污染事故或违反法律法规所造成的环境影响；
⑤建立组织内污染防止优先序列，并为实现污染预防目标而努力；
⑥可以提高监测环境的能力和评价该体系的效率，包括促进体系的改进和调整，以适应新的和不断变化的情况的要求；
⑦由于改善环境从而带来许多重要的商业、环境机会。
总之，环境管理体系将有助于组织系统化地处理环境问题，并将环境保护和企业经营结合起来，使之成为企业日常运行和经营策略的一个部分。