在系统分析阶段，我们获得了新系统的系统分析说明书，系统设计阶段的任务就是将系统分析说明书转换成一个具体的计算机实现方案－系统设计说明书。
系统设计由总体设计和详细设计这两部分组成。
一、总体设计
总体设计也称为初步或“结构设计”，在总体设计中要确定系统的模块结构，并画出模块结构图。在总体设计时必须考虑以下几个问题：
如何将一个系统和子系统划分成多个模块；
如何确定模块间传输的数据及调用关系；
如何评价并改进模块结构的质量。
总体结构在技术上有相当的难度，需要有一定的方法来指导。七十年代以来，出现了多种设计方案，其中结构化设计是较典型的方法。采用这种方法来划分子系统时应遵循以下基本原则：
(1)各子系统具有相对独立性，使子系统在内部功能及信息处理方面有良好的凝聚性；
(2)尽量减少子系统之间的数据依赖，子系统之间的数据接口简单、明确；
(3)子系统的划分尽量考虑企业的业务流程结构和企业管理职能，同时，在满足现行要求的基础上，适应企业今后的发展变化；
(4)减少系统的数据冗余，尽量避免重复存储；
(5)能够采取分阶段实现管理信息系统。