不同型号的粒子计数器，在功能方面和操作界面方面会有一些差别，但基本的操作是差不多的，粒子计数器的使用方法：
1.打开电源预热。
2.设置工作参数，如果不需要更改可以跳过，具体的按键操作参考每台仪器的产品介绍。另外，在采样状态下，设置是无效的。
3.设置完成后，即可开始采样测定，读取数据。
4.连接打印机，将数据导出打印出来，一些有内置打印机的产品可以直接打印。
一般粒子计数器的价格比较高，特别是进口产品。所以要注意保养，在使用过程中也要注意。下面就把使用的注意事项具体来说明一下：
1、当入口管被盖住或被堵塞，不要启动计数仪
2、应该在洁净环境下使用，以防止对激光传感器的损伤
3、禁止抽取含有油污、腐蚀性物质的气体，也不要测有可能产生反应的混合气体(如氢气和氧气)。这些气体也可能在计数器内产生爆炸。测这些气体需与厂家联系为取得更多的信息。
4、没有高压减压设备(如高压扩散器)不要取样压缩空气，所有的计数器被设计用于在一个大气压下操作。仪器的工作位置和采样口应处于同一气压和同一温湿度环境下，保证仪器正常工作。
5、水，溶液或其它液体都不能从入口管进入传感器。
6、粒子计数器主要用来测试净化车间干净的环境，当测的地方有松散颗粒的材质，灰尘源，喷雾处时，须最少保持距进口管至少十二英寸远。以免以上的颗粒及液体污染传感器及管路。
7、取样时，避免取样从计数器本身排出来的气体所污染的气体。
8、在连接外置打印机或连接外接温湿度传感器时，需先关掉计数器;当执行打印操作时，打印机上须有打印纸，否则会损伤打印头。
9、在搬运时，应轻搬轻放，少受振动、冲击。特别是对于台式的粒子计数器，更加要小心，以免损坏内部元件。