超净工作台适应于现代化工业、光电产业、生物制药以及科研试验等领域。超净工作台根据气流的方向分为垂直流超净工作台和水平流超净工作台，根据操作结构分为单边操作及双边操作两种形式。所以在操作中工作人员应该注意一些问题：
1.超净工作台操作使用前的准备工作
(1)开启超净工作台风机，净化台内环境。打开工作灯达到工作照度。
(2)检查超净工作台中准备的各种灭菌饲养和实验物品是否齐全。若需更换笼盒。检查灭菌笼盒准备情况，并用不锈钢推车移至超净台移门边。
(3)检查喷雾器喷洒效果及超净台内外擦抹用的药液是否已配置好。
(4)打开房间内的排风系统。排除打开笼盒时逸出的有味气体。
(5)检查IVC机组各种表头指针及目视各笼盒内的动物情况，估测IVC运行情况。
(6)记录影响实验动物繁殖、生长、发育的主要环境参数，如温度、相对湿度、日温差、笼盒内外压差等。
2.超净工作台操作使用程序及规范
(1)在操作的时候工作人员要戴好一次性口罩、帽子及医用乳胶手套。。
(2)用双手轻轻抬起IVC笼盒外端，沿笼架搁挡向外移出笼盒，放在超净工作台旁的不锈钢小推车上。
(3)用药液喷雾器充分喷洒双手手套外表及IVC笼盒的外面，消毒灭菌并沾粘住表面的尘埃，防止进入超净台时被层流气体吹扬。也可用带手套的双手浸入药液容器中，捞起并拧干药液毛巾，擦干手套外液滴，同时擦一下笼盒的外表。
(4)打开超净工作台移门，把笼盒移入超净工作台。
(5)适当拉下超净工作台移门。打开IVC笼盒盖底之间的紧固扣并打开笼盖。侧卧放在一边。