合理定期的维护对维护任何设备的正常工作都是至关重要地，这一点对生物安全柜也不例外。按照下面推荐的维护日程表对安全柜进行维护，保持其性能。
一.每日维护
1)用70%的酒精(其他杀菌剂视用户使用的材料而定)彻底对安全柜内部工作区域表面、侧壁、后壁、窗户进行表面净化。不要用含有氯的杀菌剂，因为它可能对安全柜的不锈钢结构造成损坏。也要对紫外灯和电源输出口表面进行清洁。当清洁安全柜内部区域时，操作人员除了手放以外，身体的其他任何部位不能进入安全柜
2)检查警报并检测基本气流
二.每周维护
1)用70%的酒精(其他杀菌剂视使用的材料而定)彻底对排水槽进行清洗
2)检查俘获纸孔处的残留物质
三.每月维护
1)用湿布对安全柜外部表面进行擦拭，尤其是安全柜的前面和上部，把堆积的灰尘打扫干净。
2)检查所有的维护配件的合理使用情况。
3)上述每日工作中的条目
四.每季维护
1)检查安全柜的任何物理异常或故障。检查荧光显像管确保它们工作正常
2)当不锈钢上表面有难以去除的斑点时，可以使用MEK(methyl-ethyl-ketone)。使用WEK后，快速用清水和液体清洁剂冲洗不锈钢板，并且用聚亚安酯布或者海绵进行擦拭。定期清洁不锈钢表面会使之保持表面的光滑美观。
五.每年维护
1)具备资格的认证技术人员对安全柜进行性能认证。
2)更换紫外灯
3)上述的每季维护