一、显微镜的使用方法
㈠准备工作：首先将显微镜的工作台擦干净，然后将要观察的标本和各种器具准备好。
㈡显微镜的使用
⒈取用：将显微镜从镜箱取出，取出时一手握镜臂，一手托底座将其轻放在离工作台边缘8－10厘米处，偏左的位置。
⒉低倍镜的使用
⑴对光：对光前，先安上合适的目镜（一般采用10×目镜），将10×、40×、100×物镜按照顺时针安在物镜转换器上，逆时针转动转换器使10×物镜对准载物台中央的通光孔。从目镜中观察，同时调节反光镜或接通电源，直至视场明亮、均匀为止。
使用双目显微镜对双目镜宽度要进行调节，用推或拉的方法调节两目镜之间的距离，直到在两个目镜上双眼同时观察时，两个图形的视场正好完全重合，此时镜筒刻度盘上所示的数字，就是观察者两眼瞳孔之间的距离。
根据物镜的放大倍数调节聚光镜的高度，使用油镜时由于放大倍数大，镜像亮度小，需要较强的照明，需要将聚光镜升至最高处。
调节可变光阑（光圈）使聚光镜的镜口率与物镜的镜口率一致，才能充分发挥舞静的分辨率，方法为：将显微镜调整到工作状态后，从目镜筒中拔出目镜，一边观察（向拔出目镜的目镜筒里看），一边缩小光阑，这时可看到缩小的光阑被物镜成的像，然后逐渐调大光阑，当光阑像的边缘与物镜通光孔黑圈的边缘一致时停止，这时的聚光镜镜口率与物镜镜口率就一致了。如显微镜可变光阑圆框上刻有表示口径的标尺，可调至物镜镜口率的80％，即物镜镜口率为0.65，则可变光阑的标尺调至0.65×80％＝0.52即可。
⑵观察：将标本放置在载物台上，使标本对准通光孔正中，下降镜筒或升高载物台，并从侧面观察，使物镜下端和标本逐渐接近，但不能碰到盖玻片。从目镜观察，用粗准焦螺旋慢慢升起镜筒和下降载物台直到看到标本为至，再调节细准焦螺旋至物像清晰。
⒊高倍镜的观察
在低倍镜下，找到要进一步观察的部位，移至视野中心，再上升聚光镜、逆时针转动物镜转换器换上高倍镜。合格的显微镜操作距离是由低倍镜转换到高倍镜时刚好合用的，一般稍为调节一下细准焦螺旋即可看到清晰的物像。
⒋油镜的观察
在高倍镜下看到标本后，把需要进一步放大的部位移至视野中心。上升镜筒或下降载物台约1.5厘米。将物镜转离光轴，在盖玻片所要观察的部位上滴一滴香柏油，把光阑升至最大。换上油镜，小心调节粗准焦螺旋，使油镜慢慢下降或慢慢上升载物台，从侧面观察油镜下端与标本之间的距离，当油镜的下端开始触及油滴时即可停止。从目镜观察，调节细准焦螺旋，直至看清标本物像。
观察完毕，上升镜筒或下降载物台，将油镜转离光轴，用干的擦鏡纸轻轻地吸掉油镜和盖玻片上的油，再用浸湿二甲苯的擦鏡纸擦拭两三次，最后用干净的擦鏡纸再擦拭两三次。
㈢观察后的处理工作
清洁：显微镜上的污物（残物或灰尘），用擦鏡纸擦干净，若擦不干净可蘸少许二甲苯进行擦拭。
显微镜各部分的放置：擦完后，把物镜转离光轴，把反光镜转到与载物台垂直的方向，以减少灰尘粘落上面，而后罩上鏡套，小心的放回鏡箱内，保存备用。
二、使用显微镜时应注意的事项
⒈取放时动作一定要轻，切忌震动和暴力，否则会造成光轴偏斜而影响观察，而且光学玻璃也容易损坏。
⒉由于物镜的螺丝口容易损伤，安装物镜时要特别小心，即先向左方倒转一小段，凹凸双方吻合后再向右方旋转，不要转的太紧，轻轻捻到头，再稍紧即可。
⒊鏡检标本应严格按照操作程序进行，观察时要从低倍镜开始，看清标本后再转用高倍镜、油镜。
⒋使用油镜时一定要在盖玻片上滴油后才能使用。油镜使用完后，应立即将镜头、盖玻片上的油擦干净，否则干后不易擦去，以致损伤镜头和标本。但应注意二甲苯用量不可过多，否则，物镜中的树胶溶解，透镜歪斜甚至脱落，盖玻片移动甚至连同标本一起融掉。
⒌使用时不可用手摸光学玻璃部分，如需擦拭应严格按照光学部件擦拭办法。
⒍使用的盖玻片和载玻片不能过厚或过薄。标准的盖玻片为0.17±0.02毫米，载玻片为1.1±0.04毫米。过厚或过薄将会影响显微镜成像及观察。
三、生物显微镜的擦拭和保养
㈠擦拭
⒈光学部分的擦拭
顺序：吸耳球吹――毛笔、刷子和羽毛轻刷――擦鏡纸轻擦——擦鏡纸蘸二甲苯轻擦。
镜头表面发霉和发雾可用擦鏡纸蘸少量酒精乙醚混合液（3：7）轻擦。内表面发霉和发雾，一般无法清除，所以严防发生。
⒉机械部分的擦拭
用干净的软布擦拭，或用擦鏡纸蘸二甲苯轻擦，不得用酒精和乙醚，因为这些试剂会侵蚀油漆，容易把油漆擦掉。
㈡保养
防潮、防尘、防腐蚀、放热