加强水分管理是提高烟叶产量、质量的关键。各烟区应根据烟株移栽期对土壤水分需求的特点合理供水，促进烟株早生快发。
浇足定根水。移栽后的还苗期一般为5～7天。这一时期烟苗很小，烟田耗水主要是地表蒸发，叶面蒸腾较少。由于移栽时对根系的损伤较大，根系的吸水能力减弱，因此要浇足定根水，促使根系尽快恢复生机。一般而言，当土壤含水量达到田间最大持水量的70%左右时利于还苗。
浇好还苗水。各烟区应根据当地情况浇好还苗水，促进烟苗尽快恢复生长。烟苗成活后若遇干旱气候，土壤最大持水量下降到50%以下，或叶片含水量减少7%～10%时，烟株就会出现萎蔫，此时应及时浇水或灌水。灌水时间以傍晚或清晨为宜。灌水可采取分段灌水和浅水灌溉的方法。灌水时应把握好灌水量，以水面距垄面10~15cm为宜，切忌大水漫灌或长时间泡水。有条件的地区应积极采用节水技术，如滴灌、喷灌等。
值得注意的是，移栽后应做到每天观察烟株形态变化。当发现烟株叶片白天萎蔫，傍晚和次日早晨还不能恢复时，说明土壤水分已经不能满足烟株正常生长的需要，缺水严重，必须立即灌水。
还苗后控水。还苗后即进入伸根期，根系生长快，烟株开始长出新叶。这一期间，土壤水分过多不利于烟株根系的生长，需适当进行控水，以促进生长出更多的根系。
雨季注意防涝。烟草根系需要利用土壤空气进行有氧呼吸才能维持正常的生命活动。当水分过多、呈饱和或过饱和状态时，土壤空气缺乏，烟株根系就不能正常进行有氧呼吸，烟株生长就会受阻，甚至萎蔫、死亡。
若移栽后正好遇到雨季，应注意疏通排灌沟渠，做到沟无积水。保持烟田边沟、腰沟比垄沟深3～7cm，雨后方能及时排出积水。大雨过后，应及时做好清沟排水工作，防止田间积水，减少肥料流失及病虫害发生。