（3）体系的试运行
OSHMS的运行具体上讲就是执行OSHMS文件、实现OSHMS目标、保持OSHMS持续有效和不断优化的过程。体系的有效运行，是依靠体系的组织结构进行组织协调，实施监督，执行考核，开展信息反馈，并通过体系审核和管理评审实现的。
OSH管理手册、文件的贯彻实施和OSH计划的执行，实质上就是OSHMS的运行。当OSH管理手册由最高管理者颁布、OSH管理程序文件经相关领导批准实施后，应立即分层次组织各级管理人员进行学习、贯彻执行。作为高层的管理人员，应着重掌握OSHMS的原理、原则、功能以及控制的方法；中层管理人员主要应掌握本部门体系要素的工作内容；一般员工应着重对手册的支持性文件中涉及各自岗位的操作规范、规定、程序的掌握。
OSH管理体系的运行涉及用人单位的众多部门，用人单位应抓住体系设计的要求，按照严密、协调、高效、精简、统一的原则，调整内部机构，并配备能胜任工作的管理人员，同时明确各机构的隶属关系以及协调方式，牢牢抓好体系的运行机制。当体系运行中发现各部门OSH职能存在问题，要及时采取纠正措施。
OSHMS在运行过程中，各项活动往往不可避免地发生偏离规范的现象，因而也必须重视实施监督，发现偏离问题及时反馈，以便采取纠正措施。实施OSH监督是保证体系正常运行的必要手段，而OSH信息反馈系统的功能，就在于保证OSH监督落实，保证体系能持续正常运行，通过信息反馈系统对异常信息的反馈和处理，对体系运行进行动态控制。可见，信息管理与OSH监督、组织协调工作是紧密联系在一起的，只有搞好三者的有机结合，体系才能有效地运行。
（4）体系的内部审核与管理评审
OSHMS内部审核，是为了检查与确认体系各要素的实施效果是否按照计划有效实现，它是对体系运行是否达到了规定的目标所作的系统的、独立的检查和评价，是OSHMS的一种自我保证手段。