无论气相色谱仪怎么发展，各种型号的气相色谱仪都包括六个基本单元。
各单元功能如下：
1)气源系统气源分载气和辅助气两种，载气是携带分析试样通过色谱柱，提供试样在柱内运行的动力，辅助气是提供检测器燃烧或吹扫用，有的仪器采用EPC系统对气流进行数字化控制。
2)进样系统引入试样，并保证试样汽化，有些仪器还包括试样预处理装置，例如热脱附装置(TD)、裂解装置、吹扫捕集装置、顶空进样装置。
3)柱系统试样在柱内运行的同时得到所需要的分离。
4)检测系统对柱后已被分离的组分进行检测，有的仪器还包括柱后转化(例如硅烷化装置、烃转化装置)。
5)数据采集及处理系统采集并处理检测系统输入的信号，给出最后试样定性和定量结果。
6)温控系统控制并显示进样系统、柱箱、检测器及辅助部分的温度。
所有的气相色谱仪都需包括以上六个基本单元，其功能都相同，差异的只是水平的配置，因此全面了解各单元的组成功能对仪器使用、开发及故障的分析排除都是必要的。