气相色谱仪主要由载气系统、进样系统、分离系统、检测系统、记录系统和温度控制系统等6个部分组成。每个部分都各自发挥着极为总要的作用，当然其选择要求也不尽相同，现就载气系统和分离系统做出如下总结：
1.载气系统
载气系统包括气源、气体净化、气体流速控制和流量。其作用是提供稳定而可调节的气体流以保证气相色谱仪的正常运转。
(1)载气选择载气是气相色谱仪分析中的流动相。载气的性质、净化程度及流速对气象色谱柱的分离效能、检测器的灵敏度、操作条件的稳定性均有很大的影响。可作为载气的气体很多，原则上没有腐蚀性且不与被分析组分发生化学反应的气体均可作为载气，最常用的是氦气、氢气、氩气、氮气。
(2)载气净化载气净化的目的是保证基线的稳定性及提高仪器的灵敏度。净化程度主要取决于使用的检测器及分析要求(常量或者微量分析)，对一般检测器，进化是使用一根装有硅胶、份子筛、活性炭的净化管，载气经过时可以除去微量的水分及油等。
(3)流速的控制与测定在气相色谱中对流速的控制要求很高，主要是保证操作条件的稳定性。由稳压阀、针阀、稳流阀相互配合以完成流速的精确控制。柱前流速由转子流量计指示、柱后流速用皂膜流量计测量。
2.分离系统
分离系统由色谱柱和柱箱组成。
色谱柱可视为气相色谱仪的心脏，色谱柱的选择是完成分析的关键。
色谱柱可分为填充柱和毛细管柱。填充柱一般采用不锈钢、玻璃钢或聚四氟乙烯材料制成，内径为2~6MM，长度为1~10M，形状有U形，螺旋形等，内装固定相。毛细管柱的通常内径为0.1~0.5MM、长度为25~300M的石英玻璃柱，呈螺旋形，其固定相是涂在或者键合在毛细管壁上。
对色谱柱箱的要求是：使用温度范围宽，控温精度高，热容小，升温、降温速度快，保温好。