用户选用了电泳槽后，该如何搭配合适的电泳仪电源呢?
简单的说，电泳仪电源一般可分为两类：精简型和多用型，精简型均为双稳型，而多用型都是三稳(三恒)型。无论有几种稳定功能，电泳仪电源在实际工作时只能稳其中一种参数，至于稳哪一种参数，要看电泳仪电源的设定以及电泳仪的等效负载电阻而定。
市面上销售的电泳仪电源，按电压分为高压1500～5000V、中压500～1500V、低压500V以下三种;按电流分为大电流500mA～2000mA、中电流100～500mA、小电流100mA以下三种;按功率分为大功率200～400W、中功率60～200W、小功率60W以下三种。
电泳仪电源输出的所有参数根据其型号的不同都有一个特定的工作范围，如果实际需要超过这一范围，就应当选择能够满足使用的另外型号的电泳仪电源。因为高、低压电泳仪内部结构特征不同，由于高压电泳仪常附加着多功能，而且高压电泳仪决不能空载运行(容易造成人身伤害内部器件损坏)，导致操作上难易程度的不同等。因此，选用合适规格的电泳仪很重要。
从电压的角度来看，用于核酸(琼脂糖)水平电泳、PCR电泳、DNA回收、印迹转移等实验只需最高电压300V;用于蛋白垂直电泳、种子纯度电泳、醋酸纤维膜电泳等需要使用最高电压600V左右的电泳仪;用于DNA测序(SSR分子标记)、等点聚焦电泳、双向电泳等要求最高电压3000V;用于DNA测序电泳(AFLP分子标记)要求最高电压3800V。
用户如果需要一台电泳仪电源带几个电泳槽工作时，首先要确定总电流不要超过仪器的最大范围，其次各电泳仪之间是并联的，因而每个电泳仪的电压都是相同的，总电流为各电泳仪电流之和。使用时注意不能超出电泳仪电源额定的范围。