标定前保证余氯电极膜头安装完好后放入自来水中，正确接于仪表通电二个小时以上对电极进行极化(活化)后再进行标定更为准确。
(1)零点标定：(如不使用实测pH，pH电极可不放入但要设定人工已知pH值)：把余氯电极和pH电极同时放置于蒸馏水或纯水中(无氯零度水)，操作仪表进入“零点标定”菜单，按“确认”键，待电流稳定后再按“确认”键，再按“确认”键后，此时经标定后的数据被存储，然后按“退出”返回主显示。
(2)斜率标定：
(a)有条件的参考方法：
标定用设备材料：小型搅拌器一台，实验室用余氯仪一台，250mL玻璃烧杯一只，
微量移液器一只，茨氯酸钠溶液适量，4.00或6.86pH缓冲溶液适量。
操作：在玻璃烧杯内加4.00或6.86pH的缓冲溶液200mL，放置于搅拌器上(搅拌速度低速)搅拌。将余氯电极和pH电极同时放置于缓冲溶液中，用移液器向缓冲溶液中加10-30μL的次氯酸钠溶液调制余氯液(饮用水、游泳池等：余氯值0.5-1mg/L;污水处理等：余氯值1-2-3mg/L)，用实验室余氯仪测得的实际读数输入到余氯仪仪表内。操作办法见说明书和仪表中菜单内的提示。
(b)无条件的简易办法：
自制含有余氯的水0.5-1mg/L左右，将经活化的余氯电极放入，用实验室办法测得余氯水中的实际读数，将读数输入到仪表内。操作方法：在仪表内进入“标定”菜单，闪烁的光标移至“斜率标定”，按“确认”键，待电流相对稳定后再按“确认键”，按屏幕指示输入实验室测得的数据，然后按“确认”键看到其标定出的斜率-××.××，再按“确认”键经标定的数据被保存。按“退出”键回到主显示，此时标定完毕可投入测量。
(c)余氯标准液方法：
将余氯电极和pH电极放置于已知余氯标准液中进行标定，操作方法同说明书中;余氯标准液的配置请参照《生活饮用水标准检验法》GB5750-85。
经正确标定后，通常在饮用水中(如蒸馏水、矿泉水、纯净水等)测不到余氯值或极小0.05mg/L;放入自来水中能测到数值，一般在0.05～1mg/L左右(根据当地自来水质情况)。