欧盟层面负责食品安全的主要机构有：
1.欧盟的健康和消费者保护总司（TheHealthandConsumerProtectionDirectorateGeneral）
2.欧盟食品安全局（EuropeanFoodSafetyAuthority，EFSA）
3.欧盟食品链及动物健康常设委员会（StandingCommitteeontheFoodChainandAnimalHealth，SCFCAH）
其中，有关食品安全法规的实施由欧盟的健康和消费者保护总司负责。欧盟于2002年决定设立并于2004年正式成立的独立的科学咨询机构一一欧盟食品安全局，它不具备制定规章制度的权限，只负责为欧盟委员会、欧洲议会和欧盟成员国提供风险评估结果，并为公众提供风险信息。食品链及动物健康常设委员会设立于2002年，它属于规制性委员会，委员会的成员是由成员国的代表所组成，委员会的主席是由欧盟委员会所派代表来担任。