加拿大食品检验局组织联邦、省政府和部分科研机构的专家组成科学委员会，以为风险危险性评分定级的方式，决定不同风险类型前摄性风险管理工作的轻重缓急，确定需要优先分配资金、采取积极预防行动的重点食品风险名单。一般而言，危险度评分80以上的是高危风险，60到80分属于中度风险，60分以下的危险性则比较低。风险危险度的评价完全以科学为依据，主要衡量因素是风险的可控制性（传播性）和本身的危害性。控制程度低、感染可能性高而危害大的风险就是防范工作的重中之重。
前摄性风险管理的主要方式包括对产业和消费者进行教育培训，复审与核查相关产业的HACCP计划，制定和执行相关产品的优良制造/进口规范，密切与其他国家、部门、省政府的相关合作，改进对相关产品的检测方法和战略，对产品的生产工艺与生产程序进行检验，加强抽样分析和标签核查等。
在建立严密的前摄性风险管理机制的同时，食品检验局也开发出一套食品安全事件快速反应机制。疫病爆发、消费者反馈、企业自检报告、下游产业举报、常规检查发现问题乃至其他国家和机构的有关通报、媒体揭发等都可能成为该机制的触发点。在食品安全反应程序启动后，加拿大食品检验局将迅速开展食品安全调查和风险对人、动植物和环境健康的危险性评估，在科学的基础上，根据风险性质和企业过错程度做出处理。处理方式包括警告、扣留、召回、销毁、拒绝入境、中止或者吊销执照与许可、拒绝认证、罚款乃至诉诸法庭等。在必要的时候，加拿大食品检验局会与卫生部、加拿大公共卫生健康机构及其他相关部门的科研人员与法律专家合作处理食品安全问题。