美国农业部在2002年和2005年分别制定了一套五年战略计划，分别是美国农业部2002－2007年战略计划、美国农业部2005－2010年战略计划，这两套战略计划的总体目标就是提高全民营养和健康，不断改善美国国民生活。
在美国农业部2005－2010年战略计划中，美国农业部提出如下战略目标：
战略目标1：提高美国农业的国际竞争力，包括扩大美国农产品的国际出口、提高美国农业的国际经济发展和贸易水平、完善卫生和检疫体系，以促进农业贸易。
战略目标2：增强农村和农场经济的竞争力和持续力，包括扩大国内市场机会、提高国内农业生产体系和市场体系的效率、为农场主提供风险管理工具和财政方面的援助。
战略目标3：增加经济机会，提高美国农村生活质量。
战略目标4：增强对国家农产品和食品供应的保护和安全保障。
战略目标5：提高国家全民营养和健康。
战略目标6：保护和改善国家自然资源基础和环境。
美国农业部规划在食品安全远景时，制定了增强公众健康：面向未来的战略，旨在指导美国有关部门继续努力，提高美国肉类、家禽和蛋产品的安全，保护公众健康。有助于指导美国在面临挑战时如何关注风险，如何在科学基础上制定解决方案。
该文件规定美国食品安全检验局将实施几个重要的行动计划，从而提高肉类和家禽产品的安全性，改进食品检验系统。这些行动计划包括：
食品安全技术——为了促进肉类和家禽安全新科技手段的应用，食品安全检验局将努力缩短从开发到实施之间的时间。
基线研究——食品安全检验局开展基线研究，以确定全国生肉及生家禽中各种致病微生物的含量。基线研究的目标是使预防和消灭食品源性致病微生物来源的工作更具有针对性。
研究议程——食品安全检验局同美国农业部的研究、教育和推广等部门配合，对食品安全研究的需求和重点进行协调。
风险分析协调——为了对长期性风险分析给予更多的重视和更好的计划，食品安全检验局将建立一个风险分析协调组。
培训——食品安全检验局将对其教育培训项目进行重新组合，使工作人员有更充分的准备去贯彻执行新的食品安全法规。
最佳管理惯例——在征求家畜饲养人员、研究人员和其他相关人员意见的基础上，食品安全检验局正在为饲养场等动物养殖机构制定一套最佳管理操作手册。
除了上述工作，强大的检测与协调系统对于一个有效的食品安全体系也是很重要的。食品安全检验局同时制订一些激励措施来促进各项制度的实施。