显微镜是实验室，特别是生物实验室必备的仪器，配备量比较大，因此正确选购显微镜很重要，不但能满足需要，还能节约经费。一般我们可以从以下几个方面来考虑。
(1)显微镜按使用目镜的数目可分为单目、双目和三目显微镜，一般用户如果要求比较简单，而且只是想要个便宜一点的显微镜，那就选用单目显微镜，一般单目显微镜比较适用于小学生，中学生，还有一些小诊所使用，还有家长给孩子购买，用的比较多，价格比较实惠，一般成交价格在5百~8百左右。而双目显微镜的价格肯定比单目的高一些，可以用两只眼睛看，因此普通的成交价格在1500~2000左右。三目的显微镜一般成交价格在3千左右
(2)光学部分：显微镜质量的核心就是其光学部分，也就是目镜和物镜部分。对于物镜来说，一般可以分为几个级别。首先是消色差物镜，使用这种物镜，不是成像所有的地方都清晰，只有视野中央60%左右的范围清晰，外周40%部分会存在一定的缺陷。通常我们会把观察部分放在视野中央，所以并不影响观察。但是如果你想要100%视野没有缺陷的话，就要用平场消色差物镜，相对而言，这种的价格就会高很多，一般是用在医疗和科研方面。还有就是介于两者之间的，也就是半平场消色差物镜。学生用的显微镜选择前面两个级别就可以了。一般的便宜点的物镜均为普通的消色差物镜，成交价格都在2000元左右。好点的就复消色差物镜或是无限远消色差物镜，成交价格在3000元左右。如果是三目的价格还更高一千多元。所以用户选购目镜就比较简单，就是看其视野的大小，推荐用大视野的目镜，因为大视野的目镜相对与一般的具有更大开口，视觉效果更好。至于选择单筒还是双筒，要看你的用途和经费情况了。中学阶段一般单筒的显微镜完全可以达到要求，高校吗，最好还是选择双筒的。
(3)结构材料：显微镜的使用寿命很长，有些可以达到10年以上，那么高质量的零部件和严密的装配就成为其使用寿命的保证。因此，应选择具有稳固结实镜架的显微镜，材质最好选择是合金的，可以减少变形。另外镜头应该是光学玻璃的，外表漆层应为光滑均匀的。还要确信你所购买的显微镜是按照有关通用标准生产的，这样的话当你以后要买相关配件时候可以方便的购买到。
(4)光源：显微镜的光源一般有三种：钨丝灯、荧光灯、卤素灯，钨丝灯也就是白炽灯。这类灯的优点是价格便宜，能提供稳定光源，试试缺点是发出的光有明显的黄色，会影响观察，另外其产生的热量太多，长时间观察会对有些材料有影响。所以显微镜如果是钨丝灯的价格就相对便宜一点，荧光灯可以提供类似太阳光的光源，产生的热量也很少，而且同样功率的荧光灯比白炽灯要亮很多，所以荧光灯会比较省电，价格方面就要贵一些，一般价格全家的1万多，有的两三万，进口的就更贵了。卤素灯可以提供很亮很白的光源，一般配在高档的显微镜上，价格会更加贵一些，所以对于高校来说，没有必要选配。
现在也讲讲进口的显微镜为什么比国厂的显微镜价格来的高
第一：进口的显微镜光学系统比较好。成像效果比较清晰，说的具体点，，第一，他的光学系统会有所不同，，第二。他的物镜参数有所不同，，一般的便宜点的物镜均为普通的消色差物镜，好点的就复消色差物镜或是无限远消色差物镜，进口的同样的消色差物镜比国产的好，菱镜的镀膜比国产的好。其实剩下的也就没什么了，那些配件都不是很重要。，其次就是他们的品牌价值了，品牌价值占主要的部分，而且他的外观啊材质啊更好更符合人机学原理。。用时间长了更不容易疲劳。。他的物镜目镜镀膜的好坏，直接影响到使用者的眼睛。所以说进口的显微镜比国厂的显微镜价格来的高，普通的生物显微镜，进口的成交价格都在1万左右。三目的就更贵7千左右。如果是配置好一些，便宜的要4万左右，贵的十几二十万
5.附属部件：显微镜选配时要考虑的附属部件主要集中于载物台的上面或者下面，也很重要的。比如光圈、聚光器等。在选购显微镜时，只要结合了以上这几点来选购显微镜你便会购买到适合自己的显微镜。