在刑侦科学中，经常涉及到对有争议的文件进行研究，从根本上来说，要解决两类问题。第一类主要解决笔迹的来源问题：是谁留下这种笔记，留下这种笔记的人独特的书写习惯是什么？对有争议的证明文件的分析与笔迹研究学无关，笔迹研究学主要是研究书写习惯于人的个性之间的关系。第二类主要是处理一些作为证据使用的文件。刑事技术人员所关心的是如何确定它的真实性：是否原件？是否经过伪造？
一般说来，我们的书写是极不规则的，常常是一天一个样。这里面包括许多的因素：情绪、书写体位以及健康状况等等，这些都能影响我们在纸上用笔书写的方式。但是一个经过训练的技术人员，却可以透过表面上的无规律看出我们每个人独特的书写方式。想要伪造笔迹是很难做到的。从书写的角度来看，我们在之上的书写从头到尾基本是一致的，写的字是大还是小，都因人而异。要制作大量的样本，花大量的时间，笔迹检验才能给出令人信服可靠的意见。
随着打字机的发明，特别是现代计算机印刷的问世，笔迹检验专家必须精通印刷技术的历史。比如说，有人拿出一份自称写于1990年的文件却是用某型号打印机打出来的，而我们知道知道2005年这款打印机才问世，这说明那份文件值得怀疑。因为打印的装置随着年月必定产生一些极易辨认的特征，如机器本身的磨损，打印针头、磁鼓的损坏等等。所以，另一台机器有着同样特征的可能性几乎是零。这也使印刷文件的真伪检验有了可能。
另外一些必须考虑的因素是墨水和纸张。墨水样品可用薄层色谱法来分析，科学家为了鉴定墨水，便收集了数千种墨水的色谱图供参考。为了避免在检验过程中出现不精确，他们还建议生产厂家每年改变墨水中的微量染料。
检验一份文件是否被更改通常使用的方法是静电检测仪(ESDA)检验。文件被放置在加电金属网的上面，一层塑料薄膜紧贴文件。当文件和薄膜被紧紧吸附到网上的时候，使用影印机的色粉和细微的玻璃粉粒的混合物，然后色粉混合物就粘附任何有静电的部分。当原件被撤去的时候，所有薄膜上相应的部分就会显示出影像。因此，把嫌疑原件的每一页和每幅影像进行比对，就可以断定原件是否被改动过的。
虽然对有争议的证明文件分析起初只运用于侦查诈骗案件，但是现在它却应用在刑事侦查的各个领域，并扮演着越来越重要的角色。