“将相互关联的过程作为系统加以识别、理解和管理，有助于组织提高实现目标的有效性和效率。”
为了成功地领导和运作一个组织，需要采用一种系统和透明的方式进行管理。这里的“系统”的含义是指将组织中为实现目标所需的全部的相互关联或相互作用的一组要素予以综合考虑。要素的集合构成了系统。要素和系统构成部分和整体的关系。一个系统相对于高于它的一级系统，它自己又是要素。因此，产生了子系统的概念。相互关联和相互作用是指要素与要素，当然也可包括要素和系统甚至系统与所处环境的联系及影响。系统内要素不是简单的排列，要素的顺序、关联及构成方式决定了系统的结构。
管理的系统方法包含有下面几个基本思想：
（1）整体性思想
每个系统都是由若干要素（子系统）构成的有机整体。系统的整体功能不是由诸多要素功能简单的迭加。系统整体功能的优化由要素的功能及要素的相互作用方式决定。
（2）层次化思想
任何复杂的系统均有一定的层次结构，处于不同层次的要素或子系统在系统中的地位和作用是不同的。系统能否有效运行，很大程度上取决于系统层次结构的确定。这要求管理者识别系统的层次、分清主次，在不同的层次间明确相应的职权及活动。
（3）目的性思想
确定系统的管理目标具有重要意义。系统的目的性和整体性是紧密相连的。若干要素的集合是为了实现总的目标，因此组织应首先明确在管理工作中的目标。第二要将目标系统化、定量化幷制定各子系统的分目标。第三力求全面协调地实现系统的目标。
（4）环境适应性思想
任何系统都存在于一定的环境中，环境对于系统的生存和发展有重大的影响。组织应充分考虑可能的环境变化，幷确保系统适应这种变化。
质量管理体系的构成要素是过程。一组完备的相互关联的过程有机地组合构成了一个系统。对构成系统的过程予以识别，理解幷管理系统，可以帮助组织提高实现目标的有效性及效率。这是一种管理的系统方法，其优点是可使过程相互协调，最大限度地实现预期的结果。
ISO9001：2000标准应用了这一管理的系统方法。在标准的4.1节中依据这一管理思想详细地提出了建立质量管理体系的系统方法的逻辑步骤。
运用“管理的系统方法”原则，组织将采取以下措施：
（1）建立一个体系，以最佳效果和最高效率实现组织的目标
每个组织都有自己的目标。目标依赖于管理活动来实现。管理应当有系统性。这可通过构造一个体系幷运作来实现。一个良好的体系是高效地实现目标的保证。质量管理体系标准为建立这样的体系提供了系统的方法和逻辑步骤（4.1），同时也指明这样的系统用文件来表述将更加清晰（4.2）。
（2）理解体系内各过程的相互依赖关系
体系是由一组关联的过程及其相互作用构成的。过程的相互作用和相互依赖关系表现在某个过程的输出是下一个过程的输入。实际是这种相互作用和相互依赖的关系是很复杂的。ISO9001：2000标准对每个过程从原则上指明了关键的相互作用和相互依赖关系。如以产品实现过程为主过程（7）而实施的管理活动（5）、资源提供（6）、测量分析和改进（8）的活动要求中所明确提出的相互关系。
（3）采用结构化方法以协调和整合过程
结构是指系统各过程关联的结合方式、排列形式和比例关系。体系实施目标的能力不仅取决于体系内的不同过程，还取决于这种过程组成体系的结构方式，以及过程之间的相互顺序、结合方式，以及哪些过程处于主要地位。通过结构化方法协调和整合过程，可使过程的能力增强，提高过程输出效果。例如在ISO9001：2000标准中对产品实现过程（7）要求策划其所需的过程，这一策划活动应当考虑结构化的方法，从而使组织的实施过程更加协调，有效地整合，以增强实现过程的能力。
（4）更好地理解为实现共同的目标所必需的作用和责任，从而减少职能交叉的障碍
质量方针和质量目标是构成组织总目标的重要组成部分。最高管理者和全体员工应理解总目标对他们的意义，以及在实现目标过程中各自的作用和责任。通过明确职能、确定责权、沟通了解，减少或消除由于职能交叉和职责不清导致的障碍，提高过程运行的效率。在ISO9001：2000标准中，职责和权限（5.5.1）的确定、内部沟通（5.5.3）以及能力意识和培训（6.2.2）活动的要求是这一措施的具体实施要求。
（5）理解组织的能力，在行动前确定资源的局限性
最高管理者及整个组织应清楚地理解保证产品实现过程和支持过程有效运作所需的资源幷应确保得到这些资源（5.1、6.1）。这些资源包括人力资源（6.2）、基础设施资源（6.3）、工作环境（6.4）及信息资源等。
（6）设定目标，幷确定体系中的特殊活动如何运作
系统的目标是通过构成系统的各过程协调运作实现的。因此，根据组织的目标，设定各过程的分目标，运作这些过程，实现其分目标，从而确保预期实现总目标是管理的系统方法的重要思想。
针对设定的总目标、分目标，体系的过程中的特殊的活动运作可能有下述几方面：
a．过程期望的结果及所达到的要求的准则（7.1）；
b．过程运作的方式（7.1）；
c．资源的提供（6.1）；
d．如何监视、测量、分析（8.2、8.4）；
e．数据搜集分析和使用（8.4）；
f．改进的方面及改进方法（8.5）。
如ISO9001：2000标准要求对产品实现过程的策划所要求的内容（7.1）。
（7）通过测量和评估，持续改进体系
持续改进体系可以通过组织的各个过程中使用PDCA循环方法实现。对于组织的特定过程，按系统的目标设定过程目标，确定过程幷实施过程，对照目标和产品要求或顾客要求测量和监视过程幷报告结果，最后采取措施，持续地改进过程业绩。同样对子系统和总系统，也可以采用同样的PDCA方式来改进体系。
为达到上述目的，需要确定：
a．怎样监视过程的业绩，包括过程能力和顾客满意（8.2.3、8.2.1）；
b．需要何种测量监视手段（7.6）；
c．如何分析信息以及从信息分析中得到什么结果（8.4）；
d．如何改进该过程（8.5）；
e．需要采取何种纠正措施和预防措施（8.5.2、8.5.3）；
f．这些纠正措施和预防措施是否得到实施且有效（5.6）。
管理的系统方法和过程方法既有区别又是有紧密联系的。这两种方法研究的对象都与过程相关，都可采用PDCA循环方式；两者均着重于关注顾客，幷通过识别组织内的关键过程，随后对其展开持续改进来增强顾客满意；目的都是为了提高有效性和效率以促进过程和体系的改进。两者的区别在于过程方法侧重于研究单个的过程，即过程的输入、输出、活动及所需的资源，该过程和其相关过程的关系，以及过程效率的提高；管理的系统方法侧重于研究若干个过程乃至过程网络组成的体系，以及体系运作如何有效地实现组织的目标。显然，过程方法是管理的系统方法的基础。管理的系统方法是将相关的、各个有效运行的过程构筑成一个有效运行的体系，从而高效地实现组织的目标。