一般来说，凡是缺氧、缺血性疾病，或由于缺氧、缺血引起的一系列疾病，高压氧治疗均可取得良好的疗效；某些感染性疾病和自身免疫性疾病，高压氧治疗也能取得较好的疗效。但是高压氧治疗必须注意以下问题：
1、高压氧不是一个固定的模式：由于压力的不同，吸氧浓度的不同，治疗效果不同；不同的疾病可能选择不同的治疗压力和吸氧方式。
2、高压氧单独治疗疾病的情况是少见的：就供氧角度来说，高压氧其最经济，最确实，最安全的供氧方式是任何其他方法无法替代的。尽管这样，高压氧也要根据不同的疾病，结合不同的药物，才能取得较好的疗效。
3、每种疾病都有其最佳治疗时机：每种疾病何时开始治疗是十分关键的，在最佳治疗时机期间，疗效较好，远离了最佳治疗时机，疗效就要打折扣了。如高压氧结合其他药物对急诊和/或早期突聋和面瘫的治疗及其有效，但如果病人在数月或数年之后才来治疗，其疗效可想而知…
4、根据不同的疾病选择不同的治疗时程：每种疾病治疗多长时间，是根据该种疾病的性质和病人的个体差异而定的。对于普通的肢体外伤，缺氧、缺血组织的成活多在两周左右就可见分晓了；对于冠心病这样的心血管疾病，一个月左右病人会发现心前区不适减少了，减轻了，用药少了；但对于神经系统的疾病，如脑损伤，轻的病人数星期，重的病人可能要数月；对于植物状态的治疗有时可达半年以上。