农药残毒快速检测仪的原理是利用速测卡中的胆碱酯酶（白色药片）可以催化靛酚乙酸酯（红色药片）水解为乙酸与靛酚（呈蓝色），由于有机磷和氨基甲酸酯类农药对胆碱酯酶的活性有抑制作用，使催化水解后的显色发生改变。因此，根据显色的不同，即可判断样品中含有机磷和氨基甲酸酯类农药的残留情况。