环境管理体系审核的目的在于对照环境管理体系审核准则中的要求来判断以下几项事项：
①衡量受审核方环境管理体系运行及符合情况；
②确定其环境管理体系是否得到了妥善的实施和保持；
③发现体系中可进一步改善的因素；
④评价组织内部管理评审是否能够保证环境管理体系的持续有效和适用。
通过环境管理体系审核使提出审核要求的组织加强内部的环境管理，其环境行为符合自身提出的环境方针，做到节能、降耗、减污，实现环境行为的持续改进。