黑木耳对胆结石、肾结石、膀胱结石、粪石等内源性异物有比较显著的化解功能。黑木耳所含的发酵和植物碱，具有促进消化道与泌尿道各种腺体分泌的特性，并协同这些分泌物催化结石，滑润管道，使结石排出。
对于初发结石，保持每天吃1~2次黑木耳，疼痛、恶呕等症状可在2~4天内缓解，结石能在10天左右消失。