1．注重改善组织质量管理体系中的薄弱环节，进一步提高质量管理体系的有效性
相对于2000版ISO9001标准，新版标准的技术内容并没有实质性的变化，只是更加明确地表述2000版ISO9001标准的内容。所谓不明确的部分，也就是许多组织在实施ISO9001标准过程中容易忽视的共性问题，并应在这些方面进一步加强，如关注与产品要求有关的法律法规要求；加强对外包过程的控制；对人员能力的要求，不仅仅局限于招聘、培训措施及其有效性，而是强调从事影响产品符合要求的人员应是能够胜任的；在顾客满意程度的测量方面，应采取一些科学有效的方法，从诸如顾客满意调查、顾客对交付产品质量的数据、用户意见调查、业务损失分析、保证承诺、经销商报告之类的来源获得输入，了解顾客对组织是否满足其要求的感受的真实信息。通过改善这些薄弱环节，来进一步提高组织质量管理体系的有效性。
2．组织在质量管理体系的设计、实施及改进过程中，应考虑其所处的商业环境
在新版标准的引言中，将“一个组织质量管理体系的设计和实施受各种需求、具体的目标、所提供的产品、所采用的过程以及组织的规模和结构的影响”改为“采用质量管理体系应当是组织的一项战略性决策。一个组织质量管理体系的设计和实施受其商业环境、环境的变化或与环境有关的风险的影响，也受各种需求、具体的目标、所提供的产品、所采用的过程以及组织的规模和结构的影响”。即使是提供同类产品的组织，其所处的商业环境不同，所设计的质量管理体系也有所不同，而且随着商业环境的变化，其质量管理体系也应发生变化，规避相关风险。所以，每个组织都应建立其各具特色的质量管理体系，并随着商业环境的变化持续改进。
3．建议组织建立一体化的质量、环境管理体系
根据ISO调查，截至2006年底，在世界上140个国家中颁发了129199份ISO14001:2004环境管理体系认证证书，中国颁发了18842张证书，占总量的14.6％，居世界第二位。而新版ISO9001的另一个目的就是加强与ISO14001:2004的兼容性。目前，负责制定质量管理体系标准的ISO/TC176和负责制定环境管理体系标准的ISO/TC207以及负责制定其他管理体系标准的TC正在起草共同愿景(jointvision)，希望提高ISO管理体系标准的兼容性，增强使用者的价值，并提出了“组织概要(Contextoftheorganization)、领导、支持、运作、绩效评价、改进”的高层结构。因此，建议已经通过质量管理体系认证和环境管理体系认证的组织借此契机，建立一体化的质量、环境管理体系。