随着光学技术的发展，显微摄影技术越来越受到人们的欢迎。现在我们可以像享受常规拍摄一样享受显微摄影带来的乐趣，体现微生物世界的奇妙。除了专业的数码显微镜以外，通过显微相机和常规显微镜的配合，也同样可以拍摄出同样的显微效果。如何通过显微成像系统拍摄出好的图片，需要我们掌握好各个拍摄环节。
如何拍摄一张好的显微摄影图片，最主要的还是取决于显微镜以及摄影设备的成像质量，在这些硬件设备一定的条件下，要拍摄一张满意的显微摄影图像，应该注意以下几点：
1制作清晰的标本片，其中组织切片应厚薄适度，染色片不应有多余的染料等。
2选择性能优良干净的载玻片和盖玻片。
3使用高性能的物镜(最好用复消色差的平场物镜)和聚光器。
4拍摄时应准确地调焦
5正确的做好白平衡
6选择合理的曝光时间
7适当控制背景噪声
8合理选择设备参数
下面以图森相机和蔡司显微镜搭配来简要说明如何使用显微成像系统进行显微拍摄
前期准备：
相机和显微镜连接
将随机附带的光盘插入光驱，完成相机驱动和软件的安装
检查显微镜的光否干净无学系统是污染，样品是否干净
目镜下调焦，观察样品。
显微拍摄操作：
启动相机：打开TSview7图片处理软件，启动相机
调焦：使用高速预览模式调焦。图森相机具有高速预览功能，方法是在调焦的时候将相机的分辨率调至较小值，以增大预览速度。而拍照的时候，则应选择在高分辨率模式下。
白平衡：左右移动载玻片，至样品完全移出聚光镜范围以外，点击自动白平衡
调节相机参数：相机参数的调节可以极大的影响图片的质量，这些参数主要包括曝光时间调节，增益调节，以及gamma值，饱和度，亮度的调节，为了拍摄更为真实的显微摄影图片，应采用适当的曝光时间同时尽量减小增益，以降低背景噪声，同时应保证gamma值，饱和度和亮度的值为0。
进行拍摄：点击拍摄按钮，系统将弹出保存界面，将文件命名之后即可保存，也可设置自动保存。
录像：点击录像按钮，即可进行录像
剪切拍摄功能：可以选择对视野范围的局部进行拍照