1、对断路器、漏电保护器、继电器等保护、自控装置产生干扰，造成误动作。使电动机产生附加损耗和发热、产生脉动转矩和噪音。使电力变压、使电动机产生附加损耗和发热、产生脉动转矩和噪音。
2、造成电流表、电压表、功率表、电能表测量误差。使照明设施寿命缩短。
3、对临近的通讯线路产生静电干扰和电磁干扰。引起配电系统静电补偿电容器发生串/并联谐振。
4、使配电线路损耗增大、发热、缩短绝缘寿命，甚至引起短路、火灾。
5、由于谐波，使电压突变造成电子设备损坏、出现误动作，影响计算机程序正常运行。造成数据丢失，甚至损坏硬件，引起楼宇自动化、消防报警系统、安全防范系统误动作，甚至无法工作。
抑制谐波方法
方法一、采用6脉冲UPS+有源谐波滤波器，输入电流谐波《5%(额定负载)，输入功率因数0.95。这种配置，虽然输入指标非常好，但是技术仍不成熟，存在误补偿、过补偿等问题，导致主输入开关误跳闸或损坏等现象;THM有源谐波滤波器技术缺陷
方法二、采用6脉冲UPS+5次谐波滤波器，如果UPS整流装置为三相全控桥6脉整流器，由整流装置产生的谐波占所有谐波的近25-33%加5次谐波滤波器后减小到10%以下，输入功率因数0.9，可局部减小谐波电流对电网的危害。这种配置，输入电流谐波仍然偏大，对发电机容量配比要求为1：2以上，并存在导致发电机输出异常升高的隐患;
方法三、采用移相变压器+6脉冲整流器的假12脉冲方案，其组成由2台6脉冲整流器UPS拼凑成：
方法四、采用12脉冲UPS+11次谐波滤波器，如果UPS整流装置为三相全控桥12脉冲整流器，加11次谐波滤波器后减小到4.5%以下，可基本完全消除谐波电流含量对电网的危害，价格相对有源滤波器要便宜得多。