实验室自编计算机软件在通过验证后，应编制软件使用手册，或至少一2书面方式说明系统的软硬件架构与执行环境、系统功能、系统启动程序，以及系统各项功能的操作步骤。自编软件应进行编号控制管理，并将所编源程序打印出来与磁盘文件一并保管。为保护计算机的数据的安全性，实验室应进行计算机密码管制，设定使用权限，每次进入系统时，对使用人进行身份验证；计算机软件应授权专人修改。为保证计算机数据的完整性，应有检查程序对数据在采集、传输、处理和储存过程中是否保持完整进行检查，以防数据丢失。如果对外购软件或自制软件进行了调整，则需要检查调整是否有效，是否可能对其他功能造成影响。