体系文件作为一个整体，应相互呼应，前后衔接。既要全面，又不能重复过多；既要语言精练，又要表述准确；既要有利于质量管理，又要服务于检测/校准业务的开展。因此，质量手册和程序文件编写完成后，需要对其是否符合认可准则的要求、是否全面协调、是否切实可行进行验证。当确认基本满足要求后，经过一段时间的试运行，发现其中不便操作或遗漏之外，实验室就存在问题对手册和程序文件进行修改，然后作为正式版本发布实施。质量手册的执笔人员一般较少，大多数实验室是一人执笔，在质量手册编写完成后，只要对照认可准则逐一检查，就可以验证其符合性。程序文件由于多人执笔，程序之间可能有冲突、重复、不衔接的地方，所以在编写过程中需要经常沟通。初稿完成之后要有一人来统稿，理解程序之间的相互关系，对照质量手册，对冲突之外按照管理层的要求做出选择。然后，将程序文件分发给负责和从事该项具体工作的人员，请他们结合认可准则相关要素（过程）中的具体要求进行验证。待信息反馈回来以后，再组织执笔人员具体讨论即可定稿。
质量手册规定的大多是原则问题，程序文件则更体现实验室的特色。程序文件的编写需要发挥实验室全体员工的智慧，取得相关人员的理解和支持，充分酝酿和讨论，以努力提高体系的整体运做效率。