质量手册作为纲领性文件，是在对实验室资源进行描述的基础上，对欲达到的前景目标和质量控制要素（过程）所做的阐述，宜简明扼要，不宜冗长。
程序是为进行某项活动或过程所规定的途径。每一项活动或过程如何一步一步展开，每个人在中间承担什么责任、做哪些工作、要达到什么标准，需要做出什么记录等都应有明确的要求，宜具体、可操作。作业指导书是否需要编写、细到什么程度，应视实验室的具体情况而定。人员素质参差不齐、人员流动频繁、培训考核不到位的实验室，则应有针对性地编写作业指导书。
质量手册可以包括程序文件，程序文件又可以包括作业指导书，当下一层次的文件被上一层次的文件包括（而不是引用）时，显然，上一层次的文件就会更详尽、更具体。从整体上说，实验室的规模、工作范围、活动性质=过程及其相互作用的复杂程度、人员的技能水平、培训的普及程度和效果以及可获得的相应规范本身的详略程度，都会影响到实验室编写的体系文件的数量和详略程度。