实验室整改工作大致包括以下四个步骤：
（1）制定整改计划。
通过和评审组的交流，实验室明确需整改的项目和具体要求，制定出有针对性的纠正措施，现场评审结束后，实验室质量主管在征得最高管理者同意后，应发布整改计划，明确整改内容、要求、完成期限以及整改责任部门和责任人。
（2）按计划实施整改。
在这一过程中，质量主管和质量管理部门要跟踪整改工作进展情况，检查执行效果；对实施效果不满意的，应和整改责任人或整改部门负责人沟通、努力达到评审组提出的要求。在整改实施过程中，实验室应做好记录，一方面可以提供评审组跟踪审核，另一方面也是质量改进的见证。
（3）编制整改报告。
经验证，确认纠正措施到位后，实验室应收集汇总整改见证材料并将其编目，编制整改工作报告，具体说明每一不符合项的整改情况及效果，如果有观察项，还应说明预防措施。
（4）提交整改报告。
实验室向评审组长提交整改报告。评审组长验收并填写验收及最终推荐意见后，提交CNAS秘书处评定委员会评定。