显微镜是精密光学仪器要保持高质量的状态，必须遵从一定的操作规程。要正确地对仪器进行维护和使用。
1、显微镜不要被物理损坏、被有毒物品侵蚀、辐射或其他危险触及，因为没有做这样的设计。
2、样品的重量不要超过5KG。
3、为了避免灼伤眼睛，一定要将滤色片插上，如果光亮过暗，也可以将滤色片拿掉。
4、在不适合的场合或进行不正确的操作，气体放电灯泡会爆炸，随机溅出玻璃削，可能会造成伤害。因此必须注意安全，遵循气体放电灯泡制造商的使用说明。气体放电灯泡会发出强烈的紫外线辐射能够灼伤眼睛和皮肤。
5、不要直接看灯光，也不要让皮肤直接暴露在灯光下，使用显微镜时，一定要使用仪器的保护措施——专用衰减滤色片。
6、检测线型电压是否和仪器表明的相一致。
7、电源插头必须有接地线，并且接地线须良好，否则会出现危险。
8、如果供给电压过大，有可能损坏仪器，导致暴光过亮，这时应立即关闭电源，更换元气件或进行维修。
9、当重新安装保险丝的时候，要看清楚它的型号和说明，不要使其短路。