峰拖尾
1、筛板阻塞(a、反冲色谱柱b、更换进口筛板c、更换色谱柱)
2、色谱柱塌陷(填充色谱柱)
3、干扰峰(a、使用更长的色谱柱b、改变流动相或更换色谱柱)
4、流动相PH选择错误(调整PH值。对于碱性化合物，低PH值更有利于得到对称峰)
5、样品与填料表面的溶化点发生反应(a、加入离子对试剂或碱性挥发性修饰剂b、换柱子)
峰前延
1、柱温低(升高柱温)
2、样品溶剂选择不恰当(使用流动相作为样品溶剂)
3、样品过载(降低样品含量)
4、色谱柱损坏(见A1、A2)
峰分叉
1、保护柱或分析柱污染图(取下保护柱再进行分析。如果必要更换保护柱。如果分析柱阻塞，拆下来清洗。如果问题仍然存在，可能是柱子被强保留物质污染，运用适当的再生措施。如果问题仍然存在，入口可能被阻塞，更换筛板或更换色谱柱。)
2、样品溶剂不溶于流动相(改变样品溶剂。如果可能采取流动相作为样品溶剂。)
峰变形
1、样品过载(减少样品载量)
早出的峰变形
2、样品溶剂选择不恰当(a、减少进样体积b、运用低极性样品溶剂)
早出的峰拖尾程度大于晚出的峰
1、柱外效应(a、调整系统连接(使用更短、内径更小的管路)b、使用小体积的流通池)
增加时，脱尾更严重
2、二级保留效应，反相模式(a、加入三乙胺(或碱性样品)b、加入乙酸(或酸性样品)c、加入盐或缓冲剂(或离子化样品)d、更换一支柱子)
3、二级保留效应，正相模式(a、加入三乙胺(或碱性样品)b、加入乙酸(或酸性样品)c、加入水(或多官能团化合物)d、试用另一种方法)
4、二级保留效应，离子对(加入三乙胺(或碱性样品))
酸性或碱性化合物的峰拖尾
1、缓冲不合适(a、使用浓度50-100mM的缓冲液b、使用Pka等于流动相PH值的缓冲液)
额外的峰
1、样品中有其他组份(正常)
2、前一次进样的洗脱峰(a、增加运行时间或梯度斜率b、提高流速)
3、空位或鬼峰(a、检查流动相是否纯净b、使用流动相作为样品溶剂c、减少进样体积)
保留时间波动
1、温控不当(调好柱温)2、流动相组分变化(防止变化(蒸发、反应等))
3、色谱柱没有平衡(在每一次运行之前给予足够的时间平衡色谱柱)
保留时间不断变化
1、流速变化(重新设定流速)
2、泵中有气泡(从泵中除去气泡)
3、流动相选择不恰当(a、更换合适的流动相b、选择合适的混合流动相)
基线漂移
1、柱温波动,即使是很小的温度变化都会引起基线的波动。通常影响示差检测器、电导检测器、较低灵敏度的紫外检测器或其它光电类检测器。(控制好柱子和流动相的温度，在检测器之前使用热交换器图)
2、流动相不均匀,流动相条件变化引起的基线漂移大于温度导致的漂移。(使用HPLC级的溶剂，高纯度的盐和添加剂。流动相在使用前进行脱气，使用中使用氦气。)
3、流通池被污染或有气体(用甲醇或其他强极性溶剂冲洗流通池。如有需要，可以用1M的硝酸。(不要用盐酸))
4、检测器出口阻塞,高压造成流通池窗口破裂，产生噪音基线(取出阻塞物或更换管子。参考检测器手册更换流通池窗)
5、流动相配比不当或流速变化(更改配比或流速,定期检查流动相组成及流速)
6、柱平衡慢，特别是流动相发生变化时(用中等强度的溶剂进行冲洗，更改流动相时，在分析前用10-20倍体积的新流动相对柱子进行冲洗)
7、流动相污染、变质或由低品质溶剂配成(检查流动相的组成。使用高品质的化学试剂及HPLC级的溶剂)
8、样品中有强保留的物质(高K’值)以馒头峰样被洗脱出，从而表现出一个逐步升高的基线。(使用保护柱，如有必要，在进样之间或在分析过程中，定期用强溶剂冲洗柱子)
9、使用循环溶剂，但检测器未调整(重新设定基线。当检测器动力学范围发生变化时，使用新的流动相)
10、检测器没有设定在最大吸收波长处。(将波长调整至最大吸收波长处)。