1、使用前的过渡：
用乙腈：水=10：90(如果是甲醇体系则用甲醇：水=10：90)以1ml/min流速过渡30min(目的是防止缓冲盐在进入柱子时析出);
2、一天分析完成后，即使用后的清洗：
1)用乙腈：水=10：90(或甲醇：水=10：90)以1ml/min流速反向冲洗45min(目的是洗去缓冲盐，防止缓冲盐在色谱柱内存留引起使用寿命下降);
2)再用乙腈：水=90：10(或甲醇：水=90：10)1ml/min流速反向冲洗45min，(目的是洗去分析过程中积累的强保留物质，防止强保留物质在色谱柱内进一步积累，影响以后的分析，也防止强保留物质的积累导致的柱压升高)，然后色谱柱保存在乙腈：水=90：10(或甲醇：水=90：10)中;
3、如果做完一种化合物，紧接着要做另外一种化合物，由于流动相等条件不同，则请先按步骤2清洗色谱柱，再使用色谱柱;要是接下来做的样品的流动相里也含有缓冲盐，也请在步骤2清洗过后再按步骤1的方式来过渡。
1)乙腈：水=10：90或甲醇：水=10：90容易长菌，温度越高越容易长菌，实验表明，在28度条件下保存至第5天时发现长菌，不宜多配。
2)Welch公司的色谱柱都能反向冲洗或使用，如果您使用的色谱柱不能反向冲洗或使用，则无需反冲，正向冲洗本方法也适用，只是反冲的效果相对较好。