我们实验室作冷冻干燥都是拿到北京大学生科院仪器中心去做，自己没有动过手，50元一个样品一天，一般一两天也就完成了。他们对样品的要求我知道的是：不许又有机溶剂，用有机试剂处理过但是上样时没有游离的有机小分子(不包括生物大分子)是可以的，pH最好接近于7，有机分子标记到蛋白质上可以。
至于样品是否可以用冷冻干燥除此之外还要看样品在冷冻干燥过程中的稳定性，细胞在低温下会不会破裂，酶和蛋白质分子在低温下会不会冷失活(一般是由于其四级结构被破坏而引起功能丧失)。
另外有人说到，有机溶剂会损坏真空泵的密封系统.