当用自动调谐校正的时候，标准调谐物质通过真空管路进入真空离子源。在此，标准品被离子化和测定。标准品的物理位置影响有多少标准品进入和通过什么途径进入真空腔内。5793的标准品位于真空管的前面，然而5975的标准品位于离子源的上面。这样的位置于是导致5975中会吸取多的标准物质调谐，然而得到一个较低的EMV的电压。这样的调谐结果校正完之后，导致5973EMV的电压相对要小。
两者的自动调谐标准物质都一样。
设置调谐质量为69219502。目标离子丰度为500000;峰宽为0.6amu;最大推斥电压为35岁，目前设置为34.6;最大离子聚焦电压为90。
在5973和5975中使用相同的标准调谐物质会导致不同的结果。这个是因为在5975中，标准物质会通过一个更大的限流器，更加接近离子源地进入真空管路。然而5973和5975两者的运算法则一致，当测定同一样品用户使用相同的EMV卡的时候5975会得到更加低的信号响应，如果需要得到一样的响应值，用户需要自己调节的EMV使之与5973接近。这个可以通过调节方法中的EMV的抵消值或调节调谐文件中丰度目标值来完成。
应该多长时间进行一次调谐?
调谐的频率取决于分析样品的数量，特性，浓度范围。但没有确切的统一的标准。
在一天里没必要对质谱做两次调谐，解决的办法之一是结合自动调谐和快速调谐。
对于待机的机器来说，有必要做一份每二天调谐并且检查状态并且每周执行一次自动调谐的时刻表并凭此将保持机器在最佳状态。
不过，自动调谐必须在下列状况下执行：
1.换柱子，质谱的维护，或者系统关机之后。
2.新的方法改编了离子源，传输线温度以及柱流量。
3.如果没有通过灵敏度测试。
如果上面没有提及，建议这被在定量分析之前执行调谐。并保持炉度，离子源温度，传输线温度和柱子流量不变。