种子发芽室实现了可以设定各个实验段运行时间、温度、湿度、光照值功能。满足了种子发芽的一切要求，使种子发芽不再是问题了。不过在使用智能种子发芽室的时候要注意以下五点：
1、种子发芽箱虽是采用微电脑控制技术、人工模拟自然生态环境的新型试验设备，但箱内各层的温度存在差异，同一层的里面和外面的温度也存在差异，那些容积较大的培养箱内的各部位的温度均是存在一定的差别的，在使用时应引起高度重视。
2、从测量结果来看，光照培养箱的最上一层温度并不是最高的，箱体中部的温度较高。
3、种子发芽箱体内实际温度与箱体显示温度和设定温度之间都存在差异，箱体内实际温度一般都小于箱体显示温度和设定温度，在实际工作中需用温湿度记录仪来校正。
4、样品数量较少和做水稻发芽检测等体积较小的实验时，应多使用容积较小、温度较均匀的精密种子发芽箱。
5、样品数量较多和做体积较大的实验时需使用RTOP-1000D等容积较大，温度难均匀的光照培养箱时，应特别注意两点。一是按照实验对象对温度的要求不同来进行合理的放置，以确保箱内的温度都能够满足不同作物的需求。二是最上一层和最下一层最好不要放置样品。若样品数量较多且必须使用时，应定时将最上一层和最下一层的样品与中间温度较高区域的样品调换，以使各区域的样品能同步发育，在规定的初/末次计数天数内完成检测工作。