显微镜是由一个透镜或几个透镜的组合构成的一种光学仪器，是人类进入原子时代的标志。主要用于放大微小物体成为人的肉眼所能看到的仪器。显微镜把一个全新的世界展现在人类的视野里。人们第一次看到了数以百计的“新的”微小动物和植物，以及从人体到植物纤维等各种东西的内部构造。显微镜还有助于科学家发现新物种，有助于医生治疗疾病。
生物显微镜与金相显微镜的区别主要是在照明方式与物镜上面：
第一、从物镜来看，生物显微镜的高倍物镜都有考虑盖玻片厚度和载玻片、培养器皿厚度，所以其物镜是通常标有/0.17、/1.2，这是为了校正玻璃对于光折射的影响，而金相显微镜的物镜通常标有/0。
第二、生物显微镜用的是透射照明，一般用来观察透时和半透明的样本，不能用来观察不透明物体，而金相显微镜主要是落射照明方式，光源从物镜射出，主要用于观察不透明样本的表面，当然也有附带透射照明装置的较高级金相显微镜，可同时用于观察透明样本。
生物显微镜与体视显微镜及金相显微镜的区别体视显微镜也叫做立体显微镜，与生物显微镜主要区别如下：
第一、体视显微镜可以放置较高，较厚的物体，如集成电路块，较大的工件，螺丝，较厚的物体等等，而生物显微镜只能放置薄片，载玻片等等。体视显微镜的工作距离较大，通常可以达到50mm甚至150mm;而生物显微镜的检测物体的工作距离范围很少超过20mm。
第二、体视显微镜可以看见立体的图像，因为景深范围较宽的缘故。所以说，体视显微镜和生物显微镜的适应范围是不相同的，镜头的结构也有所区别。
第三、体视显微镜景深范围较大，可达达到10mm的景深范围，调节聚焦环，相当大的范围可以看见清晰的图像;而生物显微镜可能稍微转动调焦环，就看不清楚了。