指标
为了表征仪器性能，往往根据使用目的和要求而提出几个技术参数或指标来定量说明。对于流式细胞仪常用的技术指标有荧光分辨率、荧光灵敏度、适用样品浓度、分选纯度、可分析测量参数等。
荧光分辨率
强度一定的荧光在测量时是在一定道址上的一个正态分布的峰，荧光分辨率是指两相邻的峰可分辨的最小间隔。通常用变异系数(C.V值)来表示。C.V的定义式为：
C.V=σ/μ
式中，σ为标准偏差，μ是平均值。
在实际应用中，我们使用挖关系式σ=0.423FWHM;其中FWHM为峰在峰高一半处的峰宽值。目前仪器的荧光分辨率均优于2.0%。
荧光灵敏度
反映仪器所能探测的最小荧光光强的大小。一般用荧光微球上所标可测出的FITC(fluoresceinisothiocyanate异硫氰基荧光素)的最少分子数来表示。目前仪器均可达到1000左右。
分析速度/分选速度
仪器每秒种可分析/分选的数目。一般分析速度为5000～10000;分选速度掌握在1000以下。
样品浓度
主要给出仪器工作时样品浓度的适用范围。一般在1010细胞/ml的数量级。
其它技术参数尚多，不再一一介绍。