常规菌检测的目的是一种指示菌，一般以CFU/ML来计量，比如总菌数和大肠菌群，这两个一般是用来评价食品被污染的程度，因为按常理，我们生活当中接触的致病菌还是相对较少的，而且人体本身也具有免疫功能，所以如果这两个指示菌如果不超标的话，我们就有理由相信该食品是相对安全的，注意：不是绝对安全。
传统的检测方法也很简单，一般就是培养富集后计数，其大致流程是这样：
1)取样，一般都是取25g样品加入到225ml的生理盐水中，取样方法会根据样品不同有所不同。比如肉制品，可以用剪刀剪碎。
2)均质，要保证均质的力度不能太大，如果太大有可能损害样品中的微生物，有些检验人员可能就是用手捏一捏，甩一甩，也有用拍击式均质器的
3)稀释，一般来说稀释3个梯度，10倍，100倍，1000倍，而且每个稀释梯度要倒两个平板。
4)培养，把事先准备好的培养基(培养基的制备，一般要经过配比，高压灭菌等过程，当然也有配制好的商业培养基，进口的有MERCK，国产的也很多，比如陆桥)倒平板，然后划线培养或者涂抹均匀即可，只要保证尽量把含菌的稀释液涂抹开，不要有菌落重叠的现象，然后放入恒温培养箱的进行培养，培养温度与所检测微生物不同而不同，比如大肠菌群是37度，粪大肠菌群要略高一点，具体多少，我也记得不是很清楚了
5)计数，找一个比较容易计数的梯度进行计数，然后根据稀释倍数反推出样品中的微生物，计数说简单点就是数菌落的数量，如果你涂抹够开的话，每个培养前的微生物会长成一个菌落，所以个1个菌落就代表1个培养前的微生物。(说到这，我就想起我以前老是想，一个菌落是由很多个微生物组成的，光数菌落怎么会得出样品中微生物的个数呢?这就是没有考虑培养前与培养后的变化。^_^)
常规菌大概就是这样啦，目前大多数检验单位都在使用这种传统的培养方法，其优点就是便宜，廉价，但是比较慢，如今市面上有很多总菌数和大肠菌群的快速商业方法，比如3M，他们在纸片上提供现成的培养基，只需把稀释液直接接种到培养基即可，相比较而言，节省了我们制备培养基的时间，不过貌似在培养时间上并没有缩短。还有检测培养基电导率方法来检测的，因为培养前，培养基都是大分子物质，这些物质的电导率相对较低，经过微生物代谢后，被分解为小分子物质，所以电导率急剧增加，通过建一个曲线来反推微生物的个数。
致病菌的检测是不得检出的，所以要比常规菌要复杂，所耗时间更长，有可能还需要用没有选择性的培养基进行前增菌，然后再用选择性培养基进行增菌，如果有可疑菌落再挑取利用生化反应进行鉴定。
比如沙门氏菌，检测流程大致如下：
1)取样，同常规菌
2)均质，同常规菌
3)前增菌，先要用无选择性的培养基进行富集增菌，因为有可能样品中所含的沙门氏菌受伤，或较少，直接用选择性培养基培养的话，沙门氏菌不会生长，从而出现假阴性。
4)增菌，用选择性的培养基进行培养，这样大部分的微生物在选择性的培养基上都不会生长，就如同过滤一样，如果长菌，根据菌落形态学来判断到底是否为可疑菌落，如果没有可疑菌落，可以判定为阴性，如果有，挑取并做生化反应鉴定是否是真的沙门氏菌
5)做生化反应进行鉴定，这里就不说了，我也不太清楚，就知道有这个流程。