下表中列出了液相色谱常见的一些问题，右侧中则列出的日常维护的方法可以减少问题出现的频率。括号中的数字是建议进行维护的时间间隔。用户手册则提供您更多的维护方法。
溶剂瓶
问题
维护
1、进口筛板阻塞
1、
a、更换（3-6个月）
b、过滤流动相，0.5u滤膜
2、气泡
2、流动相脱气
泵
问题
维护
1、气泡
1、流动相脱气
2、泵密封损坏
2、更换（3个月）
3、单向阀损坏
3、过滤流动相，运用在线过滤，准备备用单向阀
进样阀
问题
维护
1、转子密封损坏
1、
a、不要拧的过紧
b、过滤样品
色谱柱
问题
维护
1、筛板阻塞
1、a、过滤流动相
b、过滤样品
c、运用在线过滤或保护柱
2、柱头塌陷
2、a、避免使用PH>8的流动相（针对大部分硅胶的柱子）
b、使用保护柱
c、使用预柱（饱和色谱柱）
检测器
问题
维护
1、灯失效，检测器响应降低，噪音增大
1、更换（6个月）或准备备用灯
2、流通池有气泡
2、a、保持流通池清洁
b、池后使用反压抑制器
c、流动相脱气
一般
问题
维护
1、腐蚀/摩擦损坏
1、在不使用时保持系统缓冲液的清洁