一．用水量
目前市场上的实验室超纯水机的产水量一般在15—50升/小时，50升以上的中型纯水系统。客户应根据实际用水量来选用超纯水机的规格，一般遵循2-3倍关系原则。如用水量是20-30升/天，则选用规格为15升/小时的超纯水机，如果选用规格太小，超纯水机的耗材消耗会很快，选用规格太大，则形成浪费。如果集中用水量大，则需要选购较大的纯水水箱。
二．用水水质
国家实验室标准用水有一级水、二级水、三级水三种水质，又可称为纯水、高纯水、超纯水。但大多数实验室用一种或两种水质即可，一是纯水，用于玻璃器皿的清洗等；二是高纯水或超纯水，主要用于化学分析或者液相、原子吸收等精密仪器分析。客户应根据实际水质需求来选用超纯水机的档次。以自来水为水源的超纯水机都具有两个(两种水质)的出水口，一是纯水，；二是高纯水或超纯水（严格意义上讲高纯水的电阻大于10兆欧，而超纯水的电阻大于18兆欧）。
多数客户对自己的水质需求并不清楚，国家相关部门虽然有各种水质标准，但是对具体的实验项目或仪器分析用水没有完整的量化指标，往往在选购好超纯水机之后才发现水质不达标。根据经验，可以遵循以下几个选购原则，相对应即可。
1．实验内容
分无机实验和有机实验，无机实验只需电阻大于18兆欧的水质就行，而有机实验则通常要去除水中的有机物质，所以除了电阻大于18兆欧以外，还需要总有机碳的指标。如果是生物方面的实验，在要去除水中的细菌。
2．仪器种类
客户可以根据使用的仪器种类来选择超纯水机。液相用水的电阻大于18兆欧；并且要去除有机物；原子吸收、原子荧光及环境监测仪器用水大于18兆欧就行；PCR等生命科学仪器用水除了电阻大于18兆欧以外，还需除菌，除有机物，除热源。
3．目前用水来源
如果客户目前的用水是合格的，也可以将该纯水的来源方式告知超纯水机厂商，其技术人员会根据该情况来推荐相应的规格型号。
以上三种原则是根据实际的应用经验得来的，可以参考，但是最准确的型号选择还是尽量提供详细的水质参数，如电阻、微量元素、细菌、总有机碳水平等。
三．原水水质
客户在选购超纯水机时一定要向厂商提供原水的水质状况，比如泥沙多，硬度高，地下水等情况，超纯水机的工艺是根据原水水质的好坏来确定的，泥沙多，要添加预处理装置，硬度高，要添加软化装置，含盐量高，要采用二级反渗透工艺等。如果选用以纯水为水源的超纯水机，则只需要提供水质需求和用水量就可以了。