高效液相色谱常用的检测器有紫外检测器、示差折光检测器和荧光检测器三种。
1、紫外检测器
该检测器适用于对紫外光(或可见光)有吸收性能样品的检测。其特点：使用面广(如蛋白质、核酸、氨基酸、核苷酸、多肽、激素等均可使用);灵敏度高(检测下限为10-10g/ml);线性范围宽;对温度和流速变化不敏感;可检测梯度溶液洗脱的样品。
2、示差折光检测器
凡具有与流动相折光率不同的样品组分，均可使用示差折光检测器检测。目前，糖类化合物的检测大多使用此检测系统。这一系统通用性强、操作简单，但灵敏度低(检测下限为10-7g/ml)，流动相的变化会引起折光率的变化，因此，它既不适用于痕量分析，也不适用于梯度洗脱样品的检测。
3、荧光检测器
凡具有荧光的物质，在一定条件下，其发射光的荧光强度与物质的浓度成正比。因此，这一检测器只适用于具有荧光的有机化合物(如多环芳烃、氨基酸、胺类、维生素和某些蛋白质等)的测定，其灵敏度很高(检测下限为10-12～10-14g/ml)，痕量分析和梯度洗脱作品的检测均可采用。