酶标仪实际上就是专用的光电比色计或分光光度计。其主要结构与分光光度相同。
(一)酶标仪与分光光度计的主要区别
酶标仪与分光光度计的区别主要在两个方面。其一，比色所用容器的区别。分光光度计所用的容器是比色皿，酶标仪所用的容器是微孔板。微孔板通常用透明的聚乙烯材料制成，对抗原、抗体有较强的吸附作用，用它作为固相载体。其二，入射光线的区别。测试时，分光光度计的入射光束是横向垂直通过待测溶液和比色皿，酶标仪盛装比色溶液的微孔板是多排多孔，因此，酶标仅的光束部是纵向垂直通过持测溶液和微孔板，光束既可从下向上通过比色溶液，也可从上向下通过比色溶液。
(二)酶标仪的外型构造
酶标仪的外型构造如图4-15[attach]53763[/attach]
(三)酶标仪的光路系统
酶标仪所用的单色光既可通过下涉滤光片获得，也可用分光光度计相同的单色器来获得。入射光通过微孔板底部进入比色液，利用板的移动更换比色对象。为能取得标准的测读结果，入射光必须对准孔的中央，板的移动应保持准确，移动后，复位时测读结果应具有重复性。其光路系统如图4-16。
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(四)酶标仪微孔板
微孔板是一种经事先包埋专用于放置持测样本的透明塑料板，板上有多排大小均匀一致的小孔(图4—17)，孔内都包埋着相应的抗原或抗体，微孔板上每个小孔可盛放零点几毫升的溶液。
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微孔板常见的规格有40孔板、55孔板、96孔板等多种，不同的酶标仪选用不同规格的微孔板，对其可进行一孔一孔的检测或一排一排的检测。
微处理机通过控制电路控制机械驱动机构x方向和y方向的运动来移动微孔板，从而实现自动进样检测过程。也有一些酶标仪不配置驱动机构和控制电路，采用手工移动微孔以进行检测，使仪器更小巧，结构也更简单。