摇床的类型虽然很多，但是，最常用的是周转式摇床和往复式摇床两种。
1.周转式摇床
周转式摇床是容器随摇床在水平面上旋转振摇，多用于锥形瓶内细菌培养。周转式摇床进行振荡培养时，固定在摇床上的容器随摇床以200-250r/min的速度运动，由此带动培养物围绕着容器内壁平稳转动。
周转式摇床具有传氧速率较好，功率消耗小，培养物不会溅到瓶口等优点。因此实验室常用。其旋转速度为40-350r/min，偏心距为3-6cm。也有500r/min高转速的摇床。其传氧速率与液体深层搅拌培养相近。
2.往复式摇床
往复式摇床是容器随摇床在水个向上往返振摇，多用于在试管内增殖细菌。往复式格床进行振荡培养时，培养物被前后抛掷，引起较为激烈的搅拌和冲击，从而可以便培养物获得更高的氧供应。往复式摇床的转速和冲程对氧的吸收率有显著影响。
往复式摇床的往复频率为80-120次/Mn，冲程为8-12cm。适用于培养细菌和酵母等单细胞菌体，用于培养丝状菌时，往往在培养基表面形成固体菌膜。其缺点是由于液体冲击所产生的雾沫，容易使棉花潮湿而造成培养物的污染。
此外还有晓路扳式摇床(如同院挠板两侧上下移动，多用于电泳凝胶染色等)、三维摇床(烧挠板十周转式)、轨道圆周式、倾斜旋转式摇床(形如倾斜的陀螺，中轴呈一定角度倾斜，板面做三维的复杂运动，主要用来混合液体)等。