氢化物发生的主要干扰与AAS法相似，主要有液相干扰和气相干扰(见表2-2)。
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液相干扰的消除可采取以下方法：
(1)加入络合剂与干扰元素形成稳定的络合物。
(2)适当增加酸度加大金属微粒溶解度防止金属物产生。
(3)降低硼氢化钠(钾)的浓度。NaBH4的浓度越大越易引起液相干扰。
(4)某些情况下加入氧化还原电位高于干扰离子的元素，减慢干扰元素的生成速度。
(5)改变氢化物发生的方式，采用连续流动或间断流动法取代间断法。
(6)通过化学反应改变干扰元素的价态。
(7)分离干扰元素。
气相干扰的消除可采用以下几种方法：
(1)在干扰元素的氢化物产生之前除去干扰，阻止干扰元素生成气态化合物。
(2)在传输过程应减小传输效率。(用吸收法除干扰物)
(3)在进入原子化器时，应充分供给氨基(或提高温度)对热稳定性各种不同氢化物在传输管道加热使某些氢化物分解。
(4)让氢化物通过一个气相色谱柱，将干扰元素与分析元素分开。