无尘车间用空气过滤器种类繁多，根据过滤器不同使用目的，采用不同的过滤材料、不同的过滤效率和不同的结构形式，空气过滤器有各种不同的分类方法或不同的称谓。
无尘车间的过滤器按使用目的不同划分如下
1、新风处理用过滤器：用于净化空调系统的新风即室外新鲜空气的处理，通常采用粗效、中效、高中效、严高效，有时还采用高效过滤器处理新风，若产品生产要求去除化学污染物时，还需设化学过滤器等。
2、室内送风用过滤器，通常用于净化空调系统的末端过滤，通常采用亚高效、高效、超高效或ULPA+化学过滤器或HEPA+化学过滤器等。
3、排气用过滤器：为防止无尘车间内产品生产过程中产生的污染物（包括各种有害物质如有害气体、微生物---病毒、细菌或致敏物质等）对大气环境的污染，常常在无尘车间的排气管道上应设置性能可靠的排气过滤器，排气经过滤处理达到规定的排气标准后才能排入大气，一般采用亚高效、高效或高效+化学过滤器等。
4、无尘车间设备内装过滤器，这是指无尘车间内通过循环方式达到所需的空气洁净度等级使用的空气过滤器，一般采用高效、超高效或HEPA+化学过滤器或ULPA+化学过滤器。
5、制造设备内装过滤器，这是指与产品制造设备组合为一体的空气过滤器，通常采和HEPA、ULPA或HEPA+化学过滤器或ULPA+化学过滤器，此类过滤器与上述过滤器的滤材，结构形式上等均有很大差异。
根据过滤器的过滤效率分类，通常可分为粗效、中效、高中效、严高效和高效空气过滤器等，按过滤效率的分类方法是人们比较熟悉和常用的方法，现分为如下:
1、粗效空气过滤器从主要用于净化空调系统的新风首道过滤器考虑，它应该截留大气中大粒径微粒，过滤对象是5um以上的悬浮性微粒和10um以上的沉降性微粒以及各种异物，防止其进入系统，所以粗效过滤器的效率以过滤5um为准，一般粗效过滤器采用易于清洗和更换的粗中孔的无纺布滤料等，严禁采用油浸式过滤器。
2、中效过滤器由于其前面已有预过滤器截留了大粒径微粒，它又可作为一般空调系统的最后过滤器和净化空调系统中高效过滤器的预过滤器，所以主要用于截留1-10um的悬浮性微粒，它的效率是以过滤1um为准。
3、高中效过滤器可以用作一般净化程度的系统的末端过滤器，也可以为了提高净化空调系统净化效果，更好地保护高效过滤器，而用作中间过滤器，所以主要用于截留1-5um的悬浮性微粒，它的效率也以过滤1um的微粒为准。
4、严高效过滤器既可以作为无尘车间末端过滤器使用，根据要求达到一定的空气洁净度等级，也可以作高效过滤器的预过滤器，进一步提高和确保送风的洁净度，还可以作为净化空调系统新风的末级过滤，提高新风品质，所以和高效过滤器一样，主要用以截留1um以下的严微米级的微粒，其效率应以过滤0.5um的微粒为准。
5、高效过滤器它是无尘车间的最主要的末级过滤器，以实现各级空气洁净度等级别为目的，其效率习惯以过滤0.3um的微粒为准，如果进一步细分，若以实现0.1-0.3um的空气洁净度等级为目的，则效率以过滤0.12um的微粒为准，习惯称为超高效过滤器。