英国曾在灾区收集的水质样本经过检验后，发现每一毫升水含有高达16万种细菌。洪灾过后经肠道感染的传染病有痢疾、伤寒副伤寒、霍乱、有甲型肝炎。经皮肤感染的传染病有钩端螺旋体病，经蚊子传播的传染病有登革热、疟疾、乙型脑炎等，经呼吸道感染的疾病有感冒等上呼吸道感染。
最近我国多地发生洪涝灾害，各地都在组织抗洪救灾和灾后重建工作，“洪涝灾害对于人群健康的威胁具有一定的持续性和滞后性。”
如何确保灾区人民的饮用水安全和防止灾后疾病的传播就成了有关部门首要的工作。因此各部门都引进分析仪器对饮用水和疾病的转播进行监测。
各地采用在线水质监测系统、等离子体发射光谱质谱仪等先进设备检测水质，紫外灭菌器，红外人体体温计，滴血检测仪等防疫设备确保市民生活用水安全和身体健康。
惠东疾控中心加强生活饮用水检测工作
惠东县连遭强暴雨袭击，导致全县大部分地区出现洪灾，为保障生活饮用水的卫生安全，防止水源性疾病的发生，县疾控中心按照县政府的要求，加大对县城3间自来水厂——象山水厂、城南水厂、盛鑫水厂的监管力度，每天对县城3间自来水厂取水样6份用水质分析仪专项检验检测。至目前为止，县城3间自来水厂水质检测结果均符合国家《生活饮用水卫生标准》GB5749—2006，县城供水质量没有明显变化
江西省全力开展灾后防疫重建工作
江西省提出要打好灾后防疫四场硬仗。首先是抓好安置点卫生防疫工作，确保饮食饮水安全，确保环境卫生处理到位。其次，抓好爱国卫生运动，高度重视灾后环境卫生清理工作、退水地区的环境消杀工作和灾后农村饮水安全，及时淘洗水井，修复厕所和其他卫生基础设施，对淤泥、生活垃圾、粪便、腐烂植物和动物尸体，进行无害化处理。再次，抓好夏季传染病防控工作，运用红外人体体温计，滴血检测仪等做好防疫检测工作。